Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLEC4AQ9UMR7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLEC4AQ9UMR7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms