Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CIZ1Q9ULV3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CIZ1Q9ULV3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms