Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
INO80Q9ULG1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
INO80Q9ULG1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
INO80Q9ULG1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms