Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PARP4Q9UKK3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP4Q9UKK3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms