Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL4Q9UJQ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms