Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFMBT1Q9UHJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFMBT1Q9UHJ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms