Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT172Q9UG01 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFT172Q9UG01 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFT172Q9UG01 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms