Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPASTQ9UBP0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms