Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL9Q9P2J3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms