Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9Q9P2J2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF9Q9P2J2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms