Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDH10Q9P2E7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH10Q9P2E7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms