Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTGFRNQ9P2B2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms