Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT4Q9P109 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT4Q9P109 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms