Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP5Q9NZZ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms