Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EHD3Q9NZN3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms