Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSENENQ9NZ42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms