Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A12Q9NXJ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MS4A12Q9NXJ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms