Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DCAF13Q9NV06 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms