Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTLC3Q9NUV7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTLC3Q9NUV7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms