Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMBRD1Q9NUN5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMBRD1Q9NUN5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms