Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TM7SF3Q9NS93 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TM7SF3Q9NS93 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms