Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP2Q9NS61 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms