Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TULP4Q9NRJ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TULP4Q9NRJ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms