Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL28Q9NRJ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms