Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FANCFQ9NPI8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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