Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTA1Q9NP79 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VTA1Q9NP79 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms