Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUFT1Q9NNX1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms