Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPAP3Q9H6T3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms