Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms