Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXF3Q9H4D5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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