Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GGNBP2Q9H3C7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGNBP2Q9H3C7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms