Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC8Q9H0W5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms