Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLR2J2Q9GZM3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms