Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCSER1Q9C0I3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms