Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms