Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP1Q9C000 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms