Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPCDR1Q9BY65 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms