Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms