Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRRTQ9BXP5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms