Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL3Q9BXA9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms