Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIRIP3Q9BW71 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIRIP3Q9BW71 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms