Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIOK2Q9BVS4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms