Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS2Q9BVG9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS2Q9BVG9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms