Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KATNB1Q9BVA0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms