Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1orf50Q9BV19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1orf50Q9BV19 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms