Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms