Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHANK2-AS3Q9BTD1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms