Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms