Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 CDC45-207ENST00000455750 568 ntTSL 214.99□□□□□ -0.011e-41■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-210ENST00000597240 555 ntTSL 514.97□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DENND5A-216ENST00000533737 743 ntTSL 314.91□□□□□ -0.022e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 414.71□□□□□ -0.052e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 PLEKHG4-203ENST00000393966 2182 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.062e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TMBIM1-207ENST00000429501 677 ntTSL 514.56□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 BSCL2-213ENST00000463679 881 ntTSL 214.55□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 MAP1S-209ENST00000596637 573 ntTSL 414.52□□□□□ -0.092e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 CHERP-207ENST00000600432 554 ntTSL 314.41□□□□□ -0.13e-12■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 BSCL2-212ENST00000449636 545 ntTSL 314.37□□□□□ -0.112e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 MAP1S-208ENST00000595338 558 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.166e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 BSCL2-215ENST00000468505 547 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-218ENST00000600775 533 ntTSL 413.9□□□□□ -0.181e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 AC020915.6-202ENST00000637310 1463 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.64□□□□□ -0.231e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TMBIM1-210ENST00000439306 631 ntTSL 513.44□□□□□ -0.262e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 XPNPEP1-224ENST00000508275 563 ntTSL 313.37□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 MAP1S-203ENST00000593593 566 ntTSL 413.33□□□□□ -0.282e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-203ENST00000594384 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TMBIM1-204ENST00000418569 589 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TMBIM1-206ENST00000425694 569 ntTSL 213.18□□□□□ -0.32e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 KIF13A-210ENST00000506044 810 ntTSL 413.14□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DENND5A-208ENST00000528725 728 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ACACA-229ENST00000613776 1372 ntTSL 213.07□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TNRC6C-204ENST00000587990 600 ntTSL 312.92□□□□□ -0.342e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-205ENST00000596597 573 ntTSL 312.77□□□□□ -0.371e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DENND5A-203ENST00000525784 782 ntTSL 312.68□□□□□ -0.382e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 212.66□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 FAM86B3P-202ENST00000522601 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 GOT1-202ENST00000471741 716 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 EIF2AK4-205ENST00000558823 638 ntTSL 312.43□□□□□ -0.427e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-230ENST00000553257 2699 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.466e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 PSMD2-220ENST00000496925 723 ntTSL 212.1□□□□□ -0.472e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 EPC1-206ENST00000476533 550 ntTSL 310.95□□□□□ -0.662e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 MAP2K7-208ENST00000498118 168 ntTSL 310.94□□□□□ -0.663e-12■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 CCDC66-220ENST00000484623 852 ntTSL 510.92□□□□□ -0.663e-12■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-212ENST00000598880 570 ntTSL 510.9□□□□□ -0.661e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 PSMD2-203ENST00000432855 609 ntTSL 310.86□□□□□ -0.672e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-211ENST00000547312 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.686e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DENND5A-209ENST00000529977 2606 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 EPC1-207ENST00000479380 817 ntTSL 510.49□□□□□ -0.732e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TNRC6C-203ENST00000585438 682 ntTSL 510.32□□□□□ -0.762e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 GCLC-212ENST00000515580 2132 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.762e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-208ENST00000546649 2097 ntTSL 210.3□□□□□ -0.766e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 XPNPEP1-214ENST00000490740 821 ntTSL 510.26□□□□□ -0.774e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-218ENST00000548750 813 ntTSL 310.16□□□□□ -0.785e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ATP1A1-202ENST00000369494 698 ntTSL 310.13□□□□□ -0.792e-12■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 GYS1-205ENST00000484289 459 ntTSL 310.04□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-226ENST00000551476 560 ntTSL 510□□□□□ -0.815e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-206ENST00000434676 1008 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-224ENST00000550154 550 ntTSL 59.7□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-204ENST00000413295 1064 ntTSL 29.68□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-215ENST00000547932 417 ntTSL 49.66□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 BSCL2-216ENST00000470529 512 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 NUP205-209ENST00000491089 553 ntTSL 29.62□□□□□ -0.872e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 TMBIM1-222ENST00000492966 400 ntTSL 49.58□□□□□ -0.882e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 GCLC-206ENST00000509541 3774 ntTSL 59.51□□□□□ -0.892e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-214ENST00000599714 218 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 SMURF2-202ENST00000578200 339 ntTSL 58.95□□□□□ -0.982e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 NUP205-208ENST00000490439 653 ntTSL 38.94□□□□□ -0.982e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 GCLC-207ENST00000510837 776 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 XPNPEP1-208ENST00000451592 587 ntTSL 38.49□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.066e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.073e-12■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 NUP205-202ENST00000461255 1447 ntTSL 58.12□□□□□ -1.112e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 KIF13A-206ENST00000502297 4009 ntTSL 58.1□□□□□ -1.112e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 KIF13A-202ENST00000358380 4200 ntTSL 1 (best)8.01□□□□□ -1.132e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.136e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.146e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 ZNF544-207ENST00000596677 4109 ntTSL 57.68□□□□□ -1.181e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 VARS-222ENST00000470953 392 ntTSL 37.6□□□□□ -1.192e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 SDAD1-208ENST00000513089 733 ntTSL 57.59□□□□□ -1.195e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.226e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 FBL-202ENST00000593503 628 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 KMT2E-210ENST00000479838 883 ntTSL 27.01□□□□□ -1.299e-14■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.326e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 NAT10-208ENST00000532555 615 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-8■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-6■■■■□ 22.6
BUD13Q9BRD0 RAD51-209ENST00000533741 425 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.342e-8■■■■□ 22.6
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