Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM4BQ9BQ04 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM4BQ9BQ04 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms